花蓮慈濟醫院近來力推中西醫整合治療，自2017年10月成立中西醫合作住院照護中心後，已有近千名病患經由中西醫整合治療獲得良好的醫療服務並且順利出院。現本院復健科與中醫部攜手開辦「中西醫合療聯合門診」，西醫復健科與中醫針傷科對於筋骨關節疼痛方面有異曲同工之妙，亦有相輔相成之功用。將於2018年起每週二、週三、週四在本院大愛樓五樓〈中醫部門診區〉及一樓〈復健科、中醫部門診區〉為民眾服務，目的在找到病患的病因與可選擇的治療方式，希望能讓腦血管疾病、失智症、運動傷害、一般筋骨疼痛的病患，除了熱電療、超音波、牽引、蠟療等傳統復健科治療方式幫助肢體活動恢復外，再由中醫針灸傷提供更深入的治療給予病患相輔相成的加成性療效及更完整的服務。